柏孜克里克千佛洞始凿于南北朝后期，历经唐、五代、宋、元朝，始终是西域地区的佛教中心之一。原共有洞窟83个，现存的57个中，有壁画的为40个，其中第20号窟壁画绘制有回鹘高昌王和王后的图象。

第33窟后壁有一幅表现佛涅磐后众弟子默立举哀的致意图，而第38窟是反映古代摩尼教生活情景的洞窟。第82、83号窟，是公元10-11世纪高昌回鹘王国强大时期，专为佛寺高僧修建的小型纪念窟。

回鹘高昌是该石窟群最繁华的时期。公元13世纪末，高昌王室东迁甘肃永昌，加之伊斯兰教传入吐鲁番后，佛教渐衰，柏孜克里克千佛洞随之衰落，在异教冲突中遭到毁坏，壁画人物的眼睛全部被挖掉。本世纪初又屡遭洋人盗劫破坏，雪上加霜，面目全非。尽管如此，劫余的佛座华丽精致，残余的壁画内容丰富，多采多姿，仍不失为一座规模宏大的文化艺术宝库。私人伴游如果你想欣赏这座石窟的壁画精华，恐怕只能去德国柏林印度艺术博物馆了。

为纪念唐僧师徒取经经过这里，景区不远处建有师徒四人的雕塑，造型来源于1986年版电视剧《西游记》，雕塑背后就是火焰山了。